[ Новые сообщения · Участники · Правила форума · Поиск · RSS ]
Страница 1 из 11
Модератор форума: Aleks37 
Forum of Aleksei Medvedev » Gromacs » Установка и настройка » checking whether the MPI cc command works... configure: erro (ошибка установки Gromacs (тема из личной переписки))
checking whether the MPI cc command works... configure: erro
Aleks37Дата: Среда, 07.12.2011, 11:54 | Сообщение # 1
Рядовой
Группа: Администраторы
Сообщений: 7
Репутация: 0
Статус: Offline
Слишком сложно до Вас добраться. Форум в цветовой гаме плохочитабельный, а блог не принимает. Целый день занимайся регистрацией, а не общаешся с интересным человеком.
Вопрос вот:
Спасибо за учебу.
по сценарию ".../2010/12/gromacs-openmpi-linux.html"
Без этого шага все проходит.
Code
# конфигурирование для mpi и double:
./configure --with-gsl --enable-double --prefix=$SOFT --with-fft=fftw3 --program-suffix=_mpi_d --enable-mpi --enable-tmpi-profiling

А после него получаем концовку
Code
suffix=_mpi_d --enable-mpi --enable-tmpi-profiling
checking build system type... x86_64-unknown-linux-gnu
checking host system type... x86_64-unknown-linux-gnu
checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c
checking whether build environment is sane... yes
checking for a thread-safe mkdir -p... /bin/mkdir -p
checking for gawk... gawk
checking whether make sets $(MAKE)... yes
checking how to create a ustar tar archive... gnutar
checking for cc... cc
checking for C compiler default output file name... a.out
checking whether the C compiler works... yes
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of executables...
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether cc accepts -g... yes
checking for cc option to accept ISO C89... none needed
checking for style of include used by make... GNU
checking dependency style of cc... gcc3
checking dependency style of cc... gcc3
checking for mpxlc... no
checking for mpicc... no
checking for mpcc... no
checking for hcc... no
checking whether the MPI cc command works... configure: error: Cannot compile and link MPI code with cc


для gromax4.5.3 & fftw3.2.2 & openmpi1.4.3
На машине: ноут i3 with Ubuntu10.10(хорошо стала на железо,но батарею садит быстро)
все упомянутые на страничке пакеты установлены
что ей не так?
perekaty@gala.net
 
Aleks37Дата: Среда, 07.12.2011, 11:54 | Сообщение # 2
Рядовой
Группа: Администраторы
Сообщений: 7
Репутация: 0
Статус: Offline
Самое интересное в последних строках:
Quote
checking for mpxlc... no
checking for mpicc... no
checking for mpcc... no
checking for hcc... no
checking whether the MPI cc command works... configure: error: Cannot compile and link MPI code with cc


1. не компилируется и не линкуется MPI с помощью компилятора, проверьте и/или переустановите gcc и cpp
2. , а также посмотрите файл ./configure, который запускаете этой командой, строку с флагом cc, которая определяет компилятор используемый для сборки, надо убедиться какой он именно, тот или не тот, дожен быть по идее, либо gcc или cpp, хотя последний не совсем компилятор.
3. еще как вариант переустановите полностью MPI библиотеки.
Пробуйте.

P.S. "Слишком сложно до Вас добраться. Форум в цветовой гаме плохочитабельный, а блог не принимает." - тем не менее добрались же. :-)
 
Aleks37Дата: Среда, 07.12.2011, 17:11 | Сообщение # 3
Рядовой
Группа: Администраторы
Сообщений: 7
Репутация: 0
Статус: Offline
Quote
Спасибо прочитал, будем пробовать. Пока установил без MPI и расчет по воде из примеров прошел. Только почемуто не сработала голая команда "ngmx". Или она без ключей неработает? (видеоплата ATI).
Спсасибо за участие


Да, на моей памяти данная команда без ключей не работает.
 
YuriyДата: Четверг, 08.12.2011, 17:55 | Сообщение # 4
Рядовой
Группа: Пользователи
Сообщений: 1
Репутация: 0
Статус: Offline
Спасибо.
Но я некоректно спросил, поскольку на запуск в таком виде "ngmx" ответ:
установите gromacs "apt-get install gromacs".
если я ее исполняю то ответ, что нужной версии в загашниках нет.
Как я понимаю ключи в єтом случае не спасут?

Добавлено (08.12.2011, 17:55)
---------------------------------------------
Не втему: пока дойдешь до места где писать свои мемуары то забудишь что и хотел. три проверки и прикаждой записи, это уже много, а времени на это столько уходит, что ни общения ни работы!
Извиняйте, ...

 
Aleks37Дата: Четверг, 08.12.2011, 19:47 | Сообщение # 5
Рядовой
Группа: Администраторы
Сообщений: 7
Репутация: 0
Статус: Offline
Quote
Спасибо.
Но я некоректно спросил, поскольку на запуск в таком виде "ngmx" ответ:
установите gromacs "apt-get install gromacs".
если я ее исполняю то ответ, что нужной версии в загашниках нет.
Как я понимаю ключи в єтом случае не спасут?


Ничего не понял, в чем вопрос еще раз, с чувством, с толком, с расстановкой!
Но прежде чем задавать, посмотрите вот эту статью .
И так внимание вопрос !?
 
Forum of Aleksei Medvedev » Gromacs » Установка и настройка » checking whether the MPI cc command works... configure: erro (ошибка установки Gromacs (тема из личной переписки))
Страница 1 из 11
Поиск: